Насколько я поняла, франшиза вычитается в любом случае.
Франшизе пофиг чья вина, если поступило заявление от владельца авто с КАСКО,страховая может потребовать доплатить франшизу,либо вычесть сумму франшизы из ущерба(взаимозачёт). Так что страхуйте лучше сразу на всю сумму вначале года,чтобы потом не искать ещё денег на ремонт.