Тоже была вода в левой нише багажника, что только не делал. Клапана снимал, силиконил, накладку пластмассовую на крыше снимал ( там только сварной шов течь нечему там) и т.д. Все оказалось просто, вода попадала через уплотнительную резинку для проводов крышки багажника. Потом промазал герметиком и вставил нормально. Вода перестала копиться в нише. Вода попадала под резинку и по проводам текла на боковину крыла, далее стекала в нишу.