Видимо надо как-то организовывать сообщество "Москва-Байкал" и потом выбирать его в программе, тогда на карте будут показываться только члены сообщества.
Пользуюсь яндекс-картами уже третий год, но о том, что можно создавать свои сообщества я не слышал. Там по умолчанию есть сообщества "авторадио" и невидимость. Про частные сообщества впервые слышу. Информация нуждается в проверке