При замене рабочего ключа-брелка, для его работы необходимо провести процедуру обучения ИММО. Т.е. привязать новый ключ. Всё надо делать по инструкции выложенной Здесь. Если ИММО будет не нужен, то надо заново залить чистый EEPROM в ЭБУ.
Все получилось. Купил наконец-то новый штатный ПДУ (у нас стоит 1000 руб.) и заново обучил.