Просто... если их обрезать и замкнуть между собой, К-линия не зайдет в пакет, а колодка диагностики будет работать.... Внимательно схемку покурить и все станет ясно.
какие способы есть для защиты от подмены ЭБУ двигателя?
Металлический кожух-сейф произвольной конструкции. Основная задача - не дать снять разъем с ЭБУ без спец.инструмента. Поищите в моих постах, я выкладывал свои варианты для разных контроллеров.