Какая сигнализация? Есть ли попытки запуска или она вообще стартером не прокручивает? Процесс подготовки к а\запуску проделал (постановка на ручник, выключение зажигания, машина продолжает работать, выходишь, закрываешь дверь, нажимаешь на закрытие, машина глохнет)?
Попробуй вставить ключ в замок зажигания и так заводи, если заведется значит с обходчика сигнал не проходит. Еще это можно определить по тому как работает бензонасос при включении сигналкой зажигания - коротко, значит иммо заблокировал, около 2 сек значит с обходом все нормально.
Куда подключили контроль работы двигателя? Лучше всего по работе генератора, тогда продолжительность работы стартера можно выставить 2-2,5 сек. Он всеравно его отключит как заведется и зимой проблем не будет.
Можно проверить контролькой есть ли поддержка зажигания на толстом желтом проводе от сигналки.
Ставили блокировки какие-нибудь?